El monarca falleció a los 96 años en el castillo de Balmoral tres horas antes de que se informara al mundo. El certificado indica que Isabel murió de vejez y que la informante de su muerte fue la princesa real, Ana.

La vejez fue la única causa de muerte sin otros factores.  Fue la  misma causa de muerte que figura en el certificado de defunción de su esposo, el príncipe Felipe, que falleció dos meses antes de cumplir los 100 años. 

En el momento de su fallecimiento solo tres personas se encontraban presentes siendo el Rey Carlos III y su hermana estaban al lado de su madre.